Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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