Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnma1Q08460 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnma1Q08460 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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