Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tgm3Q08189 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms