Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Siah1bQ06985 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms