Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoc2Q05020 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoc2Q05020 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms