Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox10Q04888 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms