Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sox8Q04886 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms