Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NfiaQ02780 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NfiaQ02780 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NfiaQ02780 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfiaQ02780 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfiaQ02780 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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