Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd1Q01822 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd1Q01822 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms