Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms