Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SeleQ00690 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms