Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gbx1P82976 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms