Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hps5P59438 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms