Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Samsn1P57725 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms