Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RxraP28700 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RxraP28700 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms