Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd10P28359 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms