Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb3P28231 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb3P28231 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb3P28231 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb3P28231 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms