Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2afxP27661 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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