Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmo2P25801 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmo2P25801 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Lmo2P25801 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Lmo2P25801 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Lmo2P25801 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmo2P25801 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms