Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax3P24610 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pax3P24610 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pax3P24610 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax3P24610 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax3P24610 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms