Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Csn1s1P19228 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Csn1s1P19228 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Csn1s1P19228 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Csn1s1P19228 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Csn1s1P19228 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Csn1s1P19228 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Csn1s1P19228 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Csn1s1P19228 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Csn1s1P19228 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms