Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms