Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Surf1P09925 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Surf1P09925 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Surf1P09925 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms