Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
H2-Eb1P04230 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms