Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm10509O88255 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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