Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn5O54942 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn5O54942 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn5O54942 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms