Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sdc4O35988 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sdc4O35988 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sdc4O35988 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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