Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Timm44O35857 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms