Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Capn6O35646 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Capn6O35646 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Capn6O35646 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Capn6O35646 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Capn6O35646 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Capn6O35646 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn6O35646 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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