Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn9O35239 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn9O35239 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms