Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Efna3O08545 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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