Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efna5O08543 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms