Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm5849J3QPE5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5849J3QPE5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms