Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim18J3QNP2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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