Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6F6VAN0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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