Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28305F6U473 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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