Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20518E9Q548 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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