Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pdzd2E9Q1M1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pdzd2E9Q1M1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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