Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Syde2E9PUP1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syde2E9PUP1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms