Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms