Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms