Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms