Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3543D3Z235 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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