Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clip3B9EHT4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms