Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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