Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms