Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpb1B2RS76 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms