Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprsB0V2N1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms