Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms