Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms